首頁 二級單位 生物資訊中心 分析軟體使用
  • 尋找：

分析軟體使用

1. IPA

- 介紹：IPA是 All-in-one, web-based 的分析軟體與資料庫，幫助研究人員分析手上分子生物學實驗後的資料，可以快速提供研究人員更多的證據與文獻去解釋複雜的實驗背景與實驗成因並建構可以延伸的假設。

- 申請人資格: 必須為北醫體系內之Principal Investigator (PI) 或是在工作機構中具有同等身分的職位。博士後研究員、研究所學生以及實驗室同仁，請使用老師帳號預約。

- 使用方式：

  1. 第一次使用時，須填寫BIC001生醫軟體預約使用申請單，送至生資中心建檔
  2. 爾後透過預約使用狀況查詢可預約之時間(如以下IPA 預約時間表)
  3. 於使用前1個工作天線上預約使用時間，每次預約以3小時為單位，若使用者為學生，請以老師帳號預約，並於備註欄填寫學生e-mail
  4. 生資中心收到預約後會於使用當日寄發密碼函，使用者即可透過windows遠端桌面方式使用IPA

- IPA預約表單: https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSeS65Ymx-AcUZ58CctDnVjLesVgWH3L2hzzU1MuUixPtXW1_A/viewform

 

2. MetaCore

- 介紹：MetaCore™主要用來對各種類型的高通量生物實驗資料進行功能分析，包括生物晶片資料、代謝組學的 資料、基因序列表達差異分析（SAGE）、蛋白體學資料、miRNA分析以及資料搜尋等功能。MetaCore™的分析平臺是一個完全以人工校正的獨特、高正確率資料庫，其中包括各種蛋白與蛋白間和蛋白與DNA或RNA之相互作用關聯網絡、各種轉錄因子、生物訊息傳導和代謝反應路徑以及各種生物活性分子的資料。能夠將各種資料進行視覺化資料的分析，並提供多種網路建構演算法。整個分析以流程的方式進行，便於操作。

- 申請人資格: 必須為北醫體系內之Principal Investigator (PI) 或是在工作機構中具有同等身分的職位。博士後研究員、研究所學生以及實驗室同仁，請使用老師帳號預約。

- 使用方式：

  1. 第一次使用時，須填寫BIC001生醫軟體預約使用申請單，送至生資中心建檔
  2. 爾後透過預約使用狀況查詢可預約之時間(如以下MetaCore 預約時間表)
  3. 於使用前1個工作天線上預約使用時間，每次預約以3小時為單位，若使用者為學生，請以老師帳號預約，並於備註欄填寫學生e-mail
  4. 生資中心收到預約後會於使用當日寄發密碼函，使用者即可透過windows遠端桌面方式使用MetaCore

- MetaCore預約表單：https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLScW1IJQuAHsi2pt4diwsDr3BZ_5SIfS2gjhsv3wKHmrdJ94uw/viewform

 

3. OmniAnalyzer

- 介紹 : 百奧智匯開發了一站式單細胞多組學數據分析軟體OmniAnalyzer，使用者不需要依賴大型伺服器，且不需要自行撰寫分析程式，在一般電腦即可使用互動式軟體操作，完成常見的單細胞數據品質把關、細胞分群、細胞註解、擬時序分析與功能性聚類分析。

- 申請人資格: 必須為北醫體系內之Principal Investigator (PI) 或是在工作機構中具有同等身分的職位。博士後研究員、研究所學生以及實驗室同仁，請使用老師帳號預約。

- 使用方式：

  1. 第一次使用時，須填寫BIC001生醫軟體預約使用申請單，送至生資中心建檔
  2. 爾後透過預約使用狀況查詢可預約之時間(如以下OmniAnalyzer 預約時間表)
  3. 於使用前1個工作天線上預約使用時間，每次預約以3小時為單位，若使用者為學生，請以老師帳號預約，並於備註欄填寫學生e-mail
  4. 生資中心收到預約後會於使用當日寄發密碼函，使用者即可透過windows遠端桌面方式使用OmniAnalyzer

- OmniAnalyzer預約表單：https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSdZ6zeEocot7IppPTn898lxYXBDAJ5APpRHH2SL3StD7tCaEw/viewform

 

4. CLCBio Workbench 運算資源申請使用

－介紹：生資中心提供高效能運算資源，以便分析高通量生醫資料。

－使用方式：每次使用前，需填寫BIC001生醫軟體預約使用申請單，並與生資中心預約諮詢，經討論後訂定使用期限並給予帳號密碼。
 



使用規則

  1. 本網站所刊載資料之著作權，除另有規定外，屬於 臺北醫學大學 數據處（下稱「本單位」）。任何人得為非營利目的自由使用。但使用時，不得變更其內容、詆毀或減損本單位名譽，且必須註明來源為「臺北醫學大學 數據處」。
  2. 具有上傳資料權限之使用者，得自行決定其資料之著作權歸屬與授權規則。本網站之使用者，應遵守之，並了解本單位對此資料不負任何法律責任。
  3. 本單位盡力維護本網站資料之即時性與正確性，但對此不負任何責任。本單位有權不經事先公告，變更網站內容。因此，凡使用者認為涉及其利益之事項，例如使用資格或日期等，請逕與本單位相關業務人員確認。
  4. 本單位盡力維護本網站資料不含任何電腦病毒。但對於任何因下載本網站資料所致電子資訊系統或其他之損害，本單位不負任何責任。
  5. 本網站所提供對其他網站之超連結，僅為使用者之便利。該被連結之他網站，並非本網站之一部分。本單位不保證所連結之他網站存在，亦不對該網站之任何內容、超連結等負責。
  6. 本網站除為提供個人服務之必要外，不使用 cookies ，也不追蹤使用者之網路使用。使用者主動提供之個人資料，除指定目的與分析本網站使用習慣外，不作其他用途。
  7. 本使用規則之修改變更，不預先公告。若使用者對於本規則或本網站有任何意見或建議，請聯繫我們。