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分析軟體使用

1. IPA

- 介紹：IPA是 All-in-one, web-based 的分析軟體與資料庫，幫助研究人員分析手上分子生物學實驗後的資料，可以快速提供研究人員更多的證據與文獻去解釋複雜的實驗背景與實驗成因並建構可以延伸的假設。

- 申請人資格: 必須為北醫體系內之Principal Investigator (PI) 或是在工作機構中具有同等身分的職位。博士後研究員、研究所學生以及實驗室同仁，請使用老師帳號預約。

- 使用方式：

  1. 第一次使用時，須填寫BIC001生醫軟體預約使用申請單，送至生資中心建檔
  2. 爾後透過預約使用狀況查詢可預約之時間(如以下IPA 預約時間表)
  3. 於使用前1個工作天線上預約使用時間，每次預約以3小時為單位，若使用者為學生，請以老師帳號預約，並於備註欄填寫學生e-mail
  4. 生資中心收到預約後會於使用當日寄發密碼函，使用者即可透過windows遠端桌面方式使用IPA

- IPA預約表單：https://tally.so/r/woAdOM

 

2. MetaCore

- 介紹：MetaCore™主要用來對各種類型的高通量生物實驗資料進行功能分析，包括生物晶片資料、代謝組學的 資料、基因序列表達差異分析（SAGE）、蛋白體學資料、miRNA分析以及資料搜尋等功能。MetaCore™的分析平臺是一個完全以人工校正的獨特、高正確率資料庫，其中包括各種蛋白與蛋白間和蛋白與DNA或RNA之相互作用關聯網絡、各種轉錄因子、生物訊息傳導和代謝反應路徑以及各種生物活性分子的資料。能夠將各種資料進行視覺化資料的分析，並提供多種網路建構演算法。整個分析以流程的方式進行，便於操作。

- 申請人資格: 必須為北醫體系內之Principal Investigator (PI) 或是在工作機構中具有同等身分的職位。博士後研究員、研究所學生以及實驗室同仁，請使用老師帳號預約。

- 使用方式：

  1. 第一次使用時，須填寫BIC001生醫軟體預約使用申請單，送至生資中心建檔
  2. 爾後透過預約使用狀況查詢可預約之時間(如以下MetaCore 預約時間表)
  3. 於使用前1個工作天線上預約使用時間，每次預約以3小時為單位，若使用者為學生，請以老師帳號預約，並於備註欄填寫學生e-mail
  4. 生資中心收到預約後會於使用當日寄發密碼函，使用者即可透過windows遠端桌面方式使用MetaCore

- MetaCore預約表單：https://tally.so/r/mDVDJX

 

3. OmniAnalyzer

- 介紹 : 百奧智匯開發了一站式單細胞多組學數據分析軟體OmniAnalyzer，使用者不需要依賴大型伺服器，且不需要自行撰寫分析程式，在一般電腦即可使用互動式軟體操作，完成常見的單細胞數據品質把關、細胞分群、細胞註解、擬時序分析與功能性聚類分析。

- 申請人資格: 必須為北醫體系內之Principal Investigator (PI) 或是在工作機構中具有同等身分的職位。博士後研究員、研究所學生以及實驗室同仁，請使用老師帳號預約。

- 使用方式：

  1. 第一次使用時，須填寫BIC001生醫軟體預約使用申請單，送至生資中心建檔
  2. 爾後透過預約使用狀況查詢可預約之時間(如以下OmniAnalyzer 預約時間表)
  3. 於使用前1個工作天線上預約使用時間，每次預約以3小時為單位，若使用者為學生，請以老師帳號預約，並於備註欄填寫學生e-mail
  4. 生資中心收到預約後會於使用當日寄發密碼函，使用者即可透過windows遠端桌面方式使用OmniAnalyzer

- OmniAnalyzer預約表單：https://tally.so/r/mZdYR5

 

4. CLCBio Workbench 運算資源申請使用

－介紹：生資中心提供高效能運算資源，以便分析高通量生醫資料。

－使用方式：每次使用前，需填寫BIC001生醫軟體預約使用申請單，並與生資中心預約諮詢，經討論後訂定使用期限並給予帳號密碼。
 



使用規則

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